Система Affymetrix GeneTitan™ – высокопроизводительное и полностью автоматизированное решение для SNP генотипирования человека и других организмов, полнотранскриптомного профилирования экспрессии генов. Система позволяет обрабатывать в автоматическом режиме до 192 образцов в день и выпускается в двух вариантах:
GeneTitan® Multi-Channel (MC) для анализа экспрессии генов и генотипирования с 300 Вт ксеноновой лампой и двумя фильтрами.
Одноканальная система GeneTitan®, применяемая для анализа экспрессии генов с внутренним светодиодным источником (LED) и одним фильтром.
В системе Affymetrix GeneTitan™ используется полностью новый формат чипов – Array Plates, включающий 16, 24, 96 или 384 отдельных чипов. За счёт этого облегчается процесс гибридизации, уменьшается объем ручных операций. Формат чипов идеально подходит для высокоскоростной и полностью автоматизированной обработки. Чипы Array Plates для системы GeneTitan обеспечивают полный охват транскрибирования человеческого генома, мыши и крысы, SNP генотипирования человека.
Наименование |
Описание |
Axiom® 384HTmyDesign™ Custom Array
|
384-чиповая панель для тестирования 1500 до 50000 генетических маркёров (SNP, делеций). |
Axiom®myDesign™ GW Array Plate, 200K-675K |
96-чиповая панель для тестирования от 200 000 до 675 000 генетических маркёров (SNP, делеций). |
Axiom® Genome-Wide BOS 1 Bovine Array |
Микрочипы для SNP-генотипирования крупного рогатого скота (КРС). Более 640 000 валидированных маркёров. |
Axiom™ Genome-WideChicken Genotyping Array |
Микрочипы генотипирования кур. Более 580 000 маркёров. |
Axiom® BuffaloGenotyping Array |
Микрочипы для генотипирования буйволов. Более 90 000 валидированных маркёров. |
Axiom®StrawberryGenotyping Array |
Микрочипы для генотипирования клубники. 95062 SNP и делеций. |
Axiom® Exome |
Решение для GWAS исследований – поиск сигнатур заболеваний на основе SNP и делеций, расположенных в экзомной части генома. Более 300 000 кодирующих SNP, включая несинонимичные и синонимичные, сплайс варианты, стоп кодоны. Около 30 000 однонуклеотидных и комплексных делеций из предварительной фазы проекта 1000 Геномов. Возможно включение дополнительных 100 000 SNP как по списку пользователя, так и из собственной базы данных Affymetrix Axiom® Genomic Database, объем которой более 11 млн. маркёров.
|
Axiom® BiobankGenotyping Arrays |
Решение для высоко-производительного полногеномного генотипирования большого числа коллекций, включая, скрининг образцов биобанков. GWAS исследования, покрытие Европейской, Азиатской, Африканской и Латиноамериканской популяций. Скрининг экзомной части: редкие, несинонимичные кодирующие SNP и делеции в белок кодирующих регионах генома. Большая часть вариантов представлена минорной аллельной частотой (MAF) менее 1%. Фармакогеномные маркёры (ADME). Количество маркёров до 610 000 SNP и делеций, из них до 115 000 возможны пользовательские.
|
Axiom® miRNA Target SiteGenotyping Arrays |